Наруто с Джирайей возвращаются в Коноху после 2-х с половиной лет тренировок (далеко от дома). Все встречают их, разговаривают, улыбаются. Конечно же, все ребята стали старше, умнее и, естественно, повысили свой ранг шиноби. Практически все ровесники Наруто - уже чуунины. Неджи, Темари и Канкуро - джоунины. Гаара так вообще Казекаге. Наруто было немного обидно, ведь он один из своей подростковой группы остался генином.
Ладно, не будем на этом задерживаться...
Через неделю, в Конохе появляется необычный парень 25-30 лет. Его левый глаз перебинтован бинтом, да ещё и очки как у сноубордиста. Этот непонятный парень находит Какаши Хатаке и вступает с ним в разговор. Говорит, что он Обито Учиха, что он тогда не умер, а спасся и покинул деревню Коноха. Какаши не мог поверить своим глазам, но это и правда был он - лучший друг. Хотя о подробностях прошлого Обито рассказывать не стал. Сказал только то, что до этого он жил в селении сокрытом в Тумане (Кири).
Идём далее...
Спустя пару недель все прижились и вроде бы было всё хорошо, но... Пошли слухи о том, что Орочимару, Саске Учиха и Якуши Кабуто собираются сделать что-то жуткое (может даже уничтожить Коноху). Организация Акацуки готовятся к поимке хвостатых демонов (девять чудовищ победить не так уж и легко). Эти две злобные компании уже даже встречались друг с другом, но объединяться не решили. В общем, они наводят тьму и ужас.
* Вот тут и начинается самое интересное. Саске Учиха каким-то образом узнал от Тоби, что его брат не хотел уничтожать клан и во всём виновато селение сокрытое в Листве. Как ни странно, Учиха поверил и в это. Благодаря этому, Итачи остался жив. Походу, что все они желают уничтожить Коноху и сравнять её с землёй.
Наруто до сих пор хочет вернуть своего лучшего друга в деревню. Но сможет ли он это сделать?
Обито и Какаши стали выполнять миссии дуэтом (два джоунина, а это не так уж и плохо).
Что будет дальше? Неизвестно. Остаётся только гадать, да и игру уже начинать!